J'ai eu une conversation contradictoire avec un apprenti latiniste prompt à la controverse, semble-t-il. J'ai vérifié.

L'erreur est de son côté. J'en parle en particulier à cause des imprécisions flottantes dans l'opinion sur la théorie de l'évolution. Apparemment (et à ma surprise), ces imprécisions tenaces s'éprouvent jusque chez certains passionnés de science et de systématique.

Il m'a soutenu qu'il y avait une différence fondamentale et conceptuelle entre généalogie et phylogénie. Pour moi, il n'y a qu'une différence d'échelle (de temps, de population), pas une différence de concept.

L'étymologie va dans mon sens, genèse signifie engendrement. La phylogénie étudie l'origine des espèces et leurs relations d'engendrement.

Un de ses arguments était la rareté des fossiles, qui aurait pour conséquence logique notre impossibilité d'en extrapoler une hiérarchie d'engendrement de la foule d'espèces présentes et passées. Cet argument n'est pas tenable, c'est à mon sens comme si l'on disait que voir un cygne noir n'est pas suffisant pour en déduire que tous les cygnes ne sont pas blancs.

Je pense que son point de vue selon lequel la classification n'est envisagée que comme une juxtaposition d'espèces qui se ressemblent, sans en extrapoler leur (à mon sens) phylogénie a pour origine les récents changements radicaux dans la classification du vivant, dus en particulier au séquençage massif de l'ADN des espèces.

Nos certitudes quant à la justesse de nos classifications ont certes pris une certaine dose de plomb dans les ailes. Cependant nos connaissances évoluent et, si en ce moment ces changements aussi nombreux que radicaux rendent un peu floues nos conceptions mentales, nous ne nous en rapprochons pas moins d'une connaissance meilleure du monde qui nous entoure ET de sa (toujours à mon sens) phylogénie. Ces avancées majeures et rapides contribuent à une certaine frénésie pour certains (moi, pour une) et à une certaine méfiance pour d'autres (j'imagine que c'était le cas de mon interlocuteur).

Pour en revenir au vocabulaire, qui est sans doute notre fondation la plus stable en matière de science (parce qu'on prend soin de la redéfinir précisément et régulièrement aussi d'ailleurs, mais pas (toujours) en même temps que les autres changements), à ce sujet de phylogénie, Wikipédia dit:

La phylogénie est l'étude des relations de parenté entre êtres vivants

• entre individus (niveau généalogique ; seule une généalogie individuelle peut répondre à la question « qui est l'ancêtre de qui ? », tandis qu'une phylogénie de groupe ne peut répondre qu'à la question « qui est le plus proche parent de qui ? ») ;
• entre populations (à l'intérieur d'une même espèce qui concrètement n'est qu'une population dont les membres sont interféconds : niveau intraspécifique) ;
• entre espèces (niveau interspécifique).

La phylogénie permet de reconstituer l'évolution des organismes vivants.